Аннотация: В статье исследуется региональная инновационная подсистема, как комплекс взаимосвязанных элементов, условий и факторов, инициирующих и осуществляющих производство, распространение и использование новых знаний, обеспечивающих развитие экономики региона и ее подсистем. Рассмотрен процесс трансфера научных исследований в экономику, обеспечивающий социально-экономическую эффективность развития региона. Рассматривается содержательная суть ресурсного обеспечения (кадрового, научно-информационного, материально-технического) и системные разрывы, возникающие в процессе трансфера научных исследований, представленные в виде модели дисбалансов. Исследование основано на общенаучных методах познания (анализ, синтез, сравнение), представлении табличной и графической интерпретации эмпирико-фактологической информации В соответствии с этапами инновационного процесса, модель позволяет выявить дисбалансы: структурно-компетентностный – несоответствие потребности и предложения научных кадровых ресурсов; спроса и предложения научных исследований – отсутствие у бизнеса потребности в научных разработках; невостребованности научных исследований – отсутствие спроса на новый товар. Предложены основные меры, позволяющие ликвидировать или снизить системный стратегический разрыв и обеспечить тем самым эффективный трансфер научных исследований в экономику региона.